La Cátedra está formada por tres tipos de órganos. En primer lugar, como órgano de gobierno, está la Comisión Mixta y su Dirección Académica. Sus funciones son las de gestión y dirección de la Cátedra para la consecución de los objetivos propuestos.

En segundo lugar, este el órgano de participación de la Cátedra, que es el Consejo y en la que todos los miembros de la Cátedra, tienen representación. Con carácter general, son competencias del Pleno del Consejo de la Cátedra formular propuestas a la Comisión Mixta, al director y al secretario en relación con las funciones que tiene asignada la Cátedra.

Finalmente, la Comisión Técnica formada por todas las entidades  asociadas, y que es  el órgano de asesoramiento de la Cátedra en las respectivas áreas disciplinares de las entidades. Las funciones de la Comisión Técnica serán las de asesorar y promover actividades que se han de incluir en Plan Anual de Actuaciones, y la Memoria Anual de actuaciones y régimen económico, así como efectuar todo tipo de propuestas de impulso de cada una de las respectivas áreas de especialización de Economía Social, a fin de que todas ellas tengan iniciativas de su competencia.